1939 yılında Eğitmen Kursu olarak açılan okul, 1940 yılında Köy Enstitüsü’ne dönüştü. 1952–1953 eğitim-öğretim yılında Beşikdüzü Kız Köy Enstitüsü adını alan okul, 1954 yılında Kız İlköğretmen Okulu oldu. 1974–1975 öğretim yılından itibaren adı Kız Öğretmen Lisesi olarak değiştirildi. 1989–1990 öğretim yılında Anadolu Öğretmen Lisesi olan okul, 2014–2015 eğitim-öğretim yılında adı değişerek İMKB Anadolu Lisesi oldu.  

        Beşikdüzü Milli Eğitim Müdürlüğü komisyonunun Nisan 2015 tarihinde yaptığı toplantıda hazırladığı gerekçeli karar doğrultusunda İMKB Anadolu Lisesi’nin Fen Lisesi’ne dönüşmesi için İl Milli Eğitim Müdürlüğü aracılığıyla Milli Eğitim Bakanlığı’na yapılan başvuru olumlu sonuçlandı. Bu konuda Kaymakam Süleyman Polat, İlçe Milli Eğitim Müdürü Mucahittin Kerim İkibaş ve Belediye Başkanı Orhan Bıçakçıoğlu’nun büyük gayretleri olduğu belirtildi.

       Belediye Başkanı Bıçakçıoğlu konuyla ilgili yaptığı kısa açıklamada, “Öncelikle Fen Lisesi Beşikdüzü’ne hayırlı olsun. AK Parti Trabzon milletvekili adayları Süleyman Soylu ve Muhammet Balta’nın, Fen Lisesinin ilçemize kazandırılmasında büyük destekleri oldu. Kendilerine teşekkür ediyorum. Fen Lisesi 2015–2016 eğitim-öğretim yılında öğrenci almaya başlayacak” dedi.                                                  

      2015–2016 Eğitim öğretim yılından itibaren Fen Lisesi olarak eğitim verecek olan Beşikdüzü İMKB Fen Lisesi, ilk öğrencilerini yeni yapılan TEOG sınavı sonuçlarına göre alacak. Okula 5 sınıf alınacak. Bir önceki yılı olmadığı için okula alınacak 150 öğrenciden en son kazanan öğrencinin puanı taban puan olacak. Fen Liselerinde sınıflardaki öğrenci sayısı 30 olması bekleniyor. Fen Liselerinin Anadolu Liselerinden farkı 10.sınıftan itibaren sayısal derslerin haftalık ders saati sayısının fazlalığı. Bu okulu kazanan öğrencilerin puanının yüksek olması, aynı seviyedeki öğrencilerin birbirleriyle yarışmaları da bir başka üstünlükleri olacak.

   Bilindiği gibi Yomra, Ortahisar (Trabzon Lisesi ), Akçaabat Fen Lisesi ve  Beşikdüzü İMKB Fen Lisesi Trabzon"daki ile birlikte dördüncü Fen Lisesi olacak.